Igas Balti riigis on olemas keskdepositoorium, kelle vastutusalasse kuulub keskregistrisse kantud väärtpaberite administreerimine ja emitentidele vastava teenuse osutamine ning nende väärtpaberitega tehtud tehingute arveldamine, s.h. DVP (tehing makse vastu) teenuste pakkumine kõikide tehingute jaoks, mis on sooritatud vastava riigi väärtpaberibörsil. Väärtpaberite ja vahendajatega seotud riski vähendamiseks on iga riigi väärtpaberituru kutselistel investoritel (maaklerid, investeerimisühingud, krediidiasutused) kohustus hoida enda ja oma klientide investeeringuid eraldi väärtpaberikontodel.

NASDAQ OMX Tallinna börsil sõlmitud tehingud arveldab Eesti Väärtpaberikeskus. 
NASDAQ OMX Riia börsil sõlmitud tehingud arveldab Läti Keskdepositoorium.
NASDAQ OMX Vilniuse börsil sõlmitud tehingud arveldab Leedu Väärtpaberikeskus. 

Eesti, Läti ja Leedu väärtpaberibörsidel toimub automaatselt sobitatud tehingute arveldamine – väärtpaberite ülekandmine müüjalt ostjale rahalise hüvitise vastu - alati kolmandal päeval pärast tehingu sõlmimist (T+3), kus T tähendab tehingu sõlmimise päeva. Erandiks on Vilniuse börsil noteeritud Leedu valituse väärtpaberitega tehingud, kus arveldused toimuvad T+1. Väärtpaberite omandiõigus läheb müüjalt üle ostjale arvelduspäeval. Väärtpaberibörsil toimunud määratud vastaspoolega tehingute arveldused toimuvad samuti vaikimisi T+3. Tallinna ja Vilniuse börsil võivad määratud vastaspoolega tehingute osapooled arveldusajaks määrata päeva vahemikus T+1 (k.a) kuni T+6 (k.a). Riia Börsil toimunud määratud vastaspoolega tehingute arveldusaega saab määrata vahemiku T+0 (k.a kohalike liikmete jaoks, v.a piiriülesed liikmed) kuni T+40 (k.a).

NASDAQ OMX Vilniuse börsi vahendusel toimunud avalike pakkumiste, ülevõtmispakkumiste ja emissioonioksjoniga seotud tehingute väärtpaberite ja rahade arveldused teostatakse kolmandal tööpäeval (T+3) peale tehingu sõlmimist kliiringpanga poolt.

Balti börsidel on tagatisfondid, mis on moodustatud börsil kauplemise õigusega börsiliikmete sissemaksetest.

Piiriülese kauplemise lihtsustamiseks Baltimaades lõid Eesti, Läti ja Leedu väärtpaberite keskdepositooriumid Baltimaade piiriülese arvelduslahenduse. Selle abil saab täna teha rahalise arvelduseta kandeid (Free-of-Payment, FOP) ja börsiväliseid rahalise arveldusega kandeid (Over-the-Counter Delivery-Versus-Payment, OTC DVP) kõigi keskregistrites registreeritud väärtpaberitega ning Balti börsidel tehtud makse vastu tehinguid (Delivery-versus-Payment, DVP). Balti väärtpaberibörside liikmed ja nende kliendid ei pea enam igas Balti riigis avama väärtpaberi- ja arvelduskontosid, et sooritada tehinguid vastava riigi kohalike väärtpaberitega. Piisab, kui neil on väärtpaberi- ja arvelduskonto avatud ainult ühes Balti riigis ning nad saavad keskdepositooriumite arvelduslahendust kasutades sooritada piiriüleseid tehinguid nii Eesti, Läti kui ka Leedu väärtpaberitega. 

Tegelikkuses tähendab see, et liikmed saavad kaubelda ja arveldada väärtpaberitega, mis on noteeritud Balti börsidel, oma väärtpaberi- ja arvelduskonto abil, mis on avatud ühes Balti riigis. Väärtpaberitehingutega seotud rahaarveldused sooritatakse väärtpaberi asukohamaa kohalikus valuutas kommertspankade vahendusel keskpangas.

Jätkuvalt toimuva Baltikumi kauplemisjärgsete praktikate ja reeglite ühtlustamise protsessi esimese sammuna rakendasid Baltikumi keskdepositooriumid ja börsid 2006. aasta aprillis ühise börsitehingute arveldamise ajakava. Alates sellest päevast on börsitehingute detailandmete ja kinnituste edastamise tähtajad kõikidel Balti turgudel samad. Siiski säilisid Läti riigi kaubeldavate võlakirjade arveldamise eritingimused.

Balti väärtpaberiarvelduste kohta lugege rohkem Eesti Väärtpaberikeskuse lehelt.